• 姓       名:高立志
  • 职       称:教授
  • 学       位:博士
  • 所在机构:华南农业大学 农学院
  • 出生年月:
  • 籍       贯:云南省大理市
  • 研究方向:我国和世界水稻育种与稻米安全的野生稻资源研究、保护和利用
个人简介 学术成果 发表论文

教育背景

1994.08至1997.07: 在中国科学院植物研究所洪德元院士指导下获得植物学理学博士学位,从事中国野生稻的群体遗传学和保护生物学研究

1991.08至1994.07: 在云南大学生物系植物学专业胡志浩教授指导下获得理学硕士学位,从事禾本科植物的分类,系统与进化研究

1987.09至1991.07: 在云南大学生物系植物学专业获得理学学士学位。

工作经历

2016.12-至今:华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心主任,博士生导师,教授。

2015.6-至今: 中国科学院昆明植物研究所博士生导师,研究员,中国科学院特聘研究员,中国科学院 “一三五”植物种质资源与基因组学研究群组群长。

2014.1-至今: 云南省热带作物科学研究所橡胶工程中心首席研究员,热带作物种质资源与基因组学重点实验室主任

2012.1-2016.12: 昆明理工大学生命科学与技术学院、信息与自动化学院特聘教授,博士生导师

2011.7-9 美国佐治亚大学遗传学系任 Visiting Faculty,合作教授为Jeffrey Lynn Bennetzen 院士

2006.6-2014.12: 中国科学院昆明植物研究所博士生导师,研究员;任国家大科学装置中国西南野生生物种质资源库副主任;植物种质资源与基因组学研究中心主任。

2006.05至2007.05: 在美国德克萨斯大学奥斯丁分校分子细胞与发育生物学系任Research Assistant Professor,对拟南芥异源四倍体形成后基因表达的进化机制开展了比较功能基因组学研究。

2005.01至2006.04: 在美国休斯顿大学生物与生物化学系任Research Assistant Professor, 与国际著名的分子进化生物学家Dan Graur教授在分子进化和生物信息学等领域开展合作,进行了LTR-反转座子对水稻基因组大小进化和基因表达与分化的影响等研究。

2003.07至2004.12: 在美国德克萨斯大学休斯顿分校的人类遗传学中心任Research Fellow, 合作导师为Hideki Innan教授。在理论群体遗传学和比较基因组学等国际前沿的学科在理论上得到系统的学习和训练,进行了基因重复的分子进化机制以及水稻的驯化与人工选择的理论群体遗传学等研究。

2002.07至2003.06: 在美国密西根大学(Ann Arbor) 生态与进化生物学系任Research Fellow, 合作导师为张建之教授。在此期间,在分子进化、生物信息学和进化基因组学等国际前沿学科和理论上得到了系统的学习和训练,进行了人类特有年轻重复基因的分子进化、与人类致病基因同源的基因在老鼠及其近缘物种中的群体遗传学和分子进化机制等方面的研究。

2000.11至2002.06: 在美国佐治亚大学遗传学系Susan Wessler 院士和John F. McDonald教授指导下作博士后研究。开始在分子进化、生物信息学和基因组学等前沿学科领域上接受了系统的学习和训练,进行了水稻LTR-反转座子在基因组中的进化研究。

1999.11至2000.11: 被遴选为联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所的Vavilov-Frankel Fellow,赴美国华盛顿大学(圣路易斯)生物学系在 Barbara A. Schaal 院士指导下作博士后研究。在此期间系统地学习和加强了群体遗传学、谱系地理学、分子系统学和保护遗传学的基础理论,开展了普通野生稻的群体遗传结构与原生境保护研究。

1999.10至2000.11: 任中国农业科学院作物品种资源研究所稻种资源研究室副研究员,主要从事水稻分子育种和我国稻种资源的研究、保护与利用。

1998.08至1998.09: 在国际水稻研究所(IRRI)作访问科学家,进行了稻种资源的保护和基因库管理以及稻属植物的分类学研究。

1997.08至1999.09: 在中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点实验室董玉琛院士指导下作博士后研究。在此期间系统地学习了植物种质资源学的基础理论和分子标记育种的技术,对我国稻种资源开展了基于水稻遗传图谱的遗传多样性、亚洲栽培稻的起源与驯化、野生稻的分子生态学和保护遗传学等方面的研究。

2003.07至2004.12: 在美国德克萨斯大学休斯顿分校的人类遗传学中心任Research Fellow, 合作导师为Hideki Innan教授。在理论群体遗传学和比较基因组学等国际前沿的学科在理论上得到系统的学习和训练,进行了基因重复的分子进化机制以及水稻的驯化与人工选择的理论群体遗传学等研究。

学术兼职

担任BMC Evolutionary Biology(2010- )的Associate Editor; 任The Open Ecology Journal(2008-2010),The Open Conservation Biology Journal(2008- ),American Journal of Plant Sciences(2010- ),Frontiers in Plant Genetics and Genomics和International Journal of Genomics and Proteomics(2010- )等国际刊物的编委; 任中国科学院昆明植物研究所学术委员会委员(2009-2014); 任中国科学院热带植物可持续利用重点实验室学术委员会委员(2013 -2018); 任中国茶叶标准委员会委员(2012-2017); 担任中国生物工程学会生物资源专业委员会委员 American Association for the Advancement of Science高级会员(Senior Membership) Sigma Xi高级会员(Senior Membership) American Society of Botany会员 Society for Molecular Biology and Evolution会员 The Society for the Study of Evolution会员 American Genetic Association 会员 Society for Conservation Biology会员 中国植物学会会员 中国遗传学会会员

为我国野生稻原生境保护体系建设与稻种资源的进一步收集保存做出了重要贡献。研究涉足了基因组学、生物信息学、进化生物学、保护遗传学、植物种质资源学和作物遗传育种等领域并做出了优异的成绩。例如,首次较为客观地认识了基因重复发生的速率,揭示了重复基因产生后被过去研究者忽视的基因转换现象及其进化机制;研究结果发表在 2004 年的 Science 后引起了极大反响,被几乎所有的国际遗传学顶尖综述性刊物(如Nature Reviews Genetics等)重点介绍引用,其科学意义业已产生了重要的影响并还正激发着大量的后续研究。带领的研究团队低成本、自主地首次在国际上完成了稻属 AA-基因组 5 个物种(尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻和南方野生稻)的基因组计划,该成果发表于美国《国家科学院刊》后,次日被国务院官网列为新闻要闻。此后该团队已完成了高度杂合的长雄蕊野生稻和普通野生稻基因组精细图谱的绘制,在国际上首次构建了多达 8 个水稻及其近缘物种的比较与进化基因组学研究框架,为我国和世界水稻科学家高效地发掘与利用野生稻种质资源奠定了坚实的科学基础。带领的团队对同源多倍体水稻的多倍化与DNA 甲基化关系的表观遗传学研究成果发表于美国《国家科学院刊》,首次为多倍化事件发生后水稻基因组进化受表观遗传修饰影响的研究提供了重要的理论基础,大大地促进了多倍体水稻育种和野生稻优异新基因资源的发掘与利用研究。 带领研究团队深入开展大叶茶、油茶和云南山茶的比较功能基因组学研究与茶种资源的保护与发掘利用,在国际上首次启动并领衔完成了茶树基因组并在植物学顶尖期刊Molecular Plant发表,成功地揭示了茶叶风味、适制性及茶树全球生态适应的遗传学基础,论文一经发表后引起了非常强烈的反响,被CCTV(新闻联播)、CNN、华盛顿邮报等几乎所有国内外重要的新闻媒体报刊的采访、报道或转载。最近,他带领的研究团队首次完成了三七基因组计划并解析三七人参皂苷的生物合成途径,对指导三七、人参和西洋参的育种、种植与深加工产业的发展具有重要意义。 在国家大科学装置“中国西南野生生物种质资源库”创建了“植物种质资源与基因组学研究中心”及人才团队,主导购置了国际一流的基因组学与生物信息学研究平台,卓有成效地推动着“植物种质资源与基因组学”学科在我国西南的建设与发展并已在国内外日益产生重要影响

科研项目

(1) 瑞典国际科学基金会(C/2738-1,2):中国野生稻的收集、调查和遗传多样性与保护生物学研究(1997.8-2002.12),3.6万美元,已顺利结题。

(2) 联合国粮农组织国际植物遗传资源研究所(IPGRI):利用SSR评价中国普通野生稻的群体遗传结构及其原生境保护的研究(1999.5-2002.5),1.5万美元,已顺利结题。

(3) 国家自然科学基金(30025005):颗粒野生稻的群体遗传结构和濒危机制的研究(1998.1-2001.12),12.5万,已顺利结题。

(4) 中国博士后管理委员会项目:亚洲栽培稻及其野生近缘植物基于遗传图谱的遗传多样性研究(1997.8-1999.9),4万,已顺利结题。

(5) 中国科学院“九五”重大项目(KZ951-B1-102):中国药用野生稻的遗传多样性和保护生物学研究(“中国重要珍稀濒危植物的保护生物学研究”子专题,1998.6-2002.12),4万,项目主持人为洪德元院士和葛颂研究员,本人为子课题主持人, 已顺利结题。

(6) 中国科学院知识创新工程方向性重点项目(KSCX2-YW-N-029):重要野生禾本科植物的比较基因组学和重要功能基因的研究(2007.1-2009.12),130万。

(7) 国家科技部“973 ”项目(2007CB815701):重要栽培植物的人工选择与基因组进化(2007.1-2012.12),60万 ,子专题负责人。

(8) 中国科学院昆明植物研究所 “” 引进人才启动项目(51O602511121):栽培稻及野生近缘植物的进化与比较功能基因组学研究(2007.1-2010.12),73万。

(9) 中国科学院昆明植物研究所创新三期领域前沿重点项目(672705232515):云南大叶茶的种质资源与基因组学的初步研究(2008.1-2012.12),80万。

(10) 云南省自然科学基金重点项目(2008CC016):云南大叶茶的起源及其重要品质相关基因的比较功能基因组学研究(2009.1-2011.12),45 万元。

(11) 中国科学院“”择优支持项目:云南大叶茶、云南山茶花和油茶的比较功能基因组学与种质资源的初步研究(2009.1-2011.12),200万元。

(12) 云南省高端科技人才引进项目(20080A009):云南大叶茶重要品质相关基因的比较功能基因组学研究(2009.1-2011.12),300万元。

(13)国家自然科学基金NSFC-云南联合基金项目(U0936603):油茶、云南大叶茶和云南山茶种质资源的保护和比较功能基因组学研究”(2010.1-2013.12),185万元。

(14)云南省自然科学基金重点项目:云南普通野生稻种质资源和基因组学的初步研究(2011.1-2013.12),40万。

(15)云南省农业创新行动计划:云南大叶茶种质资源和基因组学研究(2011.1-2015.12),180万。

(16)云南省农业创新行动计划:橡胶树种质资源和基因组学研究(2014.1-2016.12),500万。

(17)中组部“万人计划”科技创新领军人才项目(2017-2020),100万

(18)华南农业大学引进人才科研启动项目,500万

(19)华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心建设项目,2000万

2)参加的主要研究项目:

(1) 中国科学院分类与区系特别资助费项目:稻属的分子系统学与进化研究(1994-1997),10.5万,项目主持人为洪德元,已顺利结题。

(2) 中国科学院院长基金:中国稻属的进化植物学和保护生物学研究(1994-1997),10万,项目主持人为洪德元,已顺利结题。

(3) 国家“973”重大项目子专题:中国稻种资源核心种质的研究与构建(1998-2002),150万,主持人为李自超等,已顺利结题。

(4) 中国农业部“95”科技攻关项目:野生稻(Oryza longistaminata and O. rufipogon)中抗稻瘟病和白叶枯病优异基因的导入与水稻的分子标记育种(1997-2000),60万,主持人为刘旭和庞汉华,已顺利结题。

(5)美国国家国家自然科学基金植物基因组项目:植物转座子和水稻基因组进化(2000-2005),120万美元,主持人为 Susan Wessler,已顺利结题。

(6)美国国立卫生研究所项目:年轻重复基因的功能分化进化机制的研究(2002-2007),100万美元,主持人为Jian-zhi Zhang,已顺利结题。

(7)美国德克萨斯大学休斯敦分校启动基金:利用人和啤酒酵母及其近缘物种基因组数据进行群体遗传学研究(2003-2006),30万美元,主持人为 Hideki Innan,已顺利结题。

(8)美国休斯敦大学特聘教授启动基金:利用模式生物基因组信息进行分子进化和生物信息学研究(2004-2007),40万美元,主持人为 Dan Graur,已顺利结题。

(9)美国国家自然科学基金植物基因组项目:植物多倍化的比较功能基因组学基础(2005-2010),300万美元,主持人为Jeff Chen,参加人之一。

(10)中科院知识创新工程方向性重点项目:高山流石滩植物适应冷热胁迫快速交替的机制研究(2007-2009),100万,主持人为李唯奇,参加人之一。

论文专著

迄今在 Science(2),PNAS(2), PLoS Genetics,Molecular Plant(3), Scientific Reports (4),Trends in Genetics,Genome Biology, Plant Physiology, Genetics,Molecular Ecology,Theoretical and Applied Genetics 等国际一流刊物上发表论文近100 篇。

Xi Du, Qi Zhao, En-Hua Xia, Gao L. Z., Franck Richard, Zhu L. Yang. Mixed-reproductive strategies, competitive mating-type distribution and life cycle of fourteen black morel species. Scientific Reports 7: 1493 |DOI:10.1038/s41598-017-01682-8

Jia-huan Xu, Hai-bo Wu, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome sequence of the threatened trident maple Acer buergerianum (Aceraceae). Mitochondrial DNA Part B (accepted)

Qun-Jie Zhang,Gao L. Z.*. 2017. Rapid and recent evolution of LTR retrotransposons drives rice genome evolution during the speciation of AA- genome Oryza species. G3-Genes Genomes Genetics https://doi.org/10.1534/g3.116.037572

Wei Li, Yuan Liu, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome of the endangered wild Musa itinerans (Zingiberales: Musaceae). Conservation Genetics Resources DOI: 10.1007/s12686-017-0737-x

Ge-Ran Hutang, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome sequence of Leersia perrieri of the rice tribe Oryzeae (Poaceae). Conservation Genetics Resources DOI: 10.1007/s12686-017-0729-x

En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Jun Sheng, Kui Li, Qun-Jie Zhang, Changhoon Kim, Yun Zhang, Yuan Liu, Ting Zhu, Wei Li, Hui Huang, Yan Tong, Hong Nan, Cong Shi, Chao Shi, Jian-Jun Jiang, Shu-Yan Mao, Jun-Ying Jiao, Dan Zhang, Yuan Zhao, You-Jie Zhao, Li-Ping Zhang, Ben-Ying Liu, Yue Yu, Sheng-Fu Shao, De-Jiang Ni, Evan E. Eichler, Gao L. Z.*. 2017. The tea tree genome provides insights into tea flavor and independent evolution of caffeine biosynthesis. Molecular Plant (http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.04.002)

En-Hua Xia, Da-Rong Yang, Jian-Jun Jiang, Qun-Jie Zhang, Yuan Liu, Yun-Long Liu, Yun Zhang, Hai-Bin Zhang, Cong Shi, Yan Tong, Changhoon Kim, Hua Chen, Yan-Qiong Peng, Yue Yu, Wei Zhang, Evan E. Eichler, Gao L. Z.*. 2017. The caterpillar fungus, Ophiocordyceps sinensis, genome provides insights into highland adaptation of fungal pathogenicity. Scientific Reports (accepted)

Dan Zhang, Wei Li, En-hua Xia, Qun-jie Zhang, Yuan Liu, Yun Zhang, Yan Tong, Yuan Zhao, Yong-chao Niu, Jia-huan Xu, Gao L. Z.*. 2017. The medicinal herb Panax notoginseng genome provides insights into ginsenoside biosynthesis and genome evolution. Molecular Plant DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.02.011

Fan-chun Zeng, You-Jie Zhao, Que-jie Zhang, Gao L. Z.*. 2017. LTRtype, an efficient tool to predict structurally complex LTR retrotransposon elements and nested insertions. Frontiers in Plant Science 8:402. doi: 10.3389/fpls.2017.00402

T Mornkham, PP Wangsomnuk, XC Mo, FO Francisco, Gao L. Z., H Kurzweil. 2016. Development and characterization of novel EST-SSR markers and their application for genetic diversity analysis of Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus L.). Genetics and Molecular Research: GMR doi: 10.4238/gmr15048857

Huang J, Zhang C, Zhao X, Fei Z, Wan K, Zhang Xiaoming Pang, Yin X, Bai Y, Sun X, Gao L. Z., Li R, Zhang J, Li X. 2016. The jujube genome provides insights into genome evolution and the domestication of sweetness/acidity taste in fruit trees. PLoS Genetics 12(12): e1006433. doi:10.1371/journal.pgen.1006433

Qing-Xia Ding, Jia Liu , Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome of eggplant (Solanum melongena L.). Mitochondrial DNA Part B 1:1, 843-844, DOI

Cheng-wen Gao, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of semi-wild soybean, Glycine gracilis (Fabales: Fabaceae). Conservation Genetics Resources (DOI: 10.1007/s12686-016-0683-z)

Cheng-wen Gao, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of wild soybean, Glycine soja (Fabales: Fabaceae). Conservation Genetics Resources (DOI 10.1007/s12686-016-0659-z)

Dan Zhang, Yuan Liu, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of Phyllostachys heterocycla, a fast-growing non-timber bamboo (Poaceae: Bambusoideae). Conservation Genetics Resources (DOI: 10.1007/s12686-016-0654-4)

Shuo Wang, Gao L. Z.*. 2016. Complete chloroplast genome sequence and annotation of the tropical japonica group of Asian cultivated rice (Oryza sativa L.). Genome Announcement 18;4(1). pii: e01703-15. doi: 10.1128/genomeA.01703-15

Gao L. Z.*, Dan Zhang, Kui Li, Ju Gao. 2016. The complete plastid genome sequence of the wild-rice Zizania latifolia and comparative chloroplast genomics of the tribe Oryzeae. Frontiers in Ecology and Evolution 4:88. doi: 10.3389/fevo.2016.00088

Chao Shi, Shuo Wang, En-Hua Xia, Jian-Jun Jiang, Fan-Chun Zeng, Qiu-Yang Yao, and Gao L. Z.*. 2016. Full transcription of the photosynthetic eukaryote chloroplast genome. Scientific Reports 6 doi:10.1038/srep30135

Gao L. Z.*, Cheng-wen Gao. 2016. Lowered diversity and increased inbreeding depression within peripheral populations of an endangered wild rice Oryza rufipogon. PLoS ONE 11(3): e0150468. doi: 10.1371/journal.pone.0150468

Qiu-Yang Yao, Hui Huang, Yan Tong, Gao L. Z.*. 2016. Transcriptome sequencing reveals gene expression profiles of flavonoid and fatty acid biosynthesis pathways and the development of EST-SSR markers in Camellia reticulata (Theaceae). Frontiers in Plant Science doi: 10.3389/fpls.2016.00163

En-Hua Xia*, Qiu-Yang Yao*, Hai-Bin Zhang, Jian-Jun Jiang, Li-Ping Zhang, Gao L. Z.*. 2016. CandiSSR: an efficient pipeline used for identifying candidate polymorphic SSRs based on multiple assembled sequences. Frontiers in Plant Science 6:1171. doi: 10.3389/fpls.2015.01171

Wang S, Shi C, Zhang YJ, Hu GX, Gao L. Z.*. 2016. Trading away ancient amber's secrets. Science 351(6276):926. doi: 10.1126/science.351.6276.926-a.

Ning Wang, Gao L. Z.* 2015. Genome-wide analysis of WRKY family of transcription factors in common bean, Phaseolus vulgaris: chromosomal localization, protein structure, evolution and expression divergence. Plant Gene 5: 22–30

Shuo Wang, Gao L. Z.* 2015. Complete chloroplast genome sequence of green foxtail (Setaria viridis), a promising model system for C4 photosynthesis. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1079867

Shuo Wang, Gao L. Z.* 2015. Complete chloroplast genome sequence of an irreplaceable dietary and model crop, foxtail millet (Setaria italica). Mitochondrial DNA: 1-2. DOI: 10.3109/19401736.2015.1089562

Shuo Wang, Cheng-wen Gao, Gao L. Z.* 2015. Plastid genome sequence of an ornamental and editable fruit tree of Rosaceae, Prunus mume. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1089546

Jie Zhang, Xiang-dong Liu, Gao L. Z.*. 2015. Methylome of autotetraploid rice revealed DNA methylation variation of transposable elements and their effects on gene expression. Proc Natl Acad Sci USA 112(50): E7022–E7029

Zengjie Han, Wei Li, Yuan Liu, Gao L. Z.* 2015. The complete chloroplast genome of North American ginseng, Panax quinquefolius. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1066365

Dan Zhang, Wei Li, Chengwen Gao, Yuan Liu, Gao L. Z.* 2015. The complete plastid genome sequence of Panax notoginseng and comparative chloroplast genomics of the family Araliaceae. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI: 10.3109/19401736.2015.1063131

Bang Liu, Gao L. Z.* 2015. The complete chloroplast genome sequence of Cucumis sativus var. Hardwickii, the wild progenitor of cultivated cucumber. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI: 10.3109/19401736.2015.1101588

Jie Zhang, Dan Zhang, Chao Shi, Ju Gao, Gao L. Z.*. 2015. The complete chloroplast genome sequence of Chikusichloa aquatica (Poaceae: Oryzeae). Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1053058

Bang Liu, Xiao-di Hu, Gao L. Z.* 2015. The complete mitochondrial genome of the central chimpanzee, Pan troglodytes troglodytes. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1053060

Hai-Bin Zhang, En-Hua Xia, Hui-Huang, Jian-Jun Jiang, Ben-ying Liu and Gao L. Z.*. 2015. De novo transcriptome assembly of the wild relative of tea tree (Camellia taliensis) and comparative analysis with tea transcriptome identified putative genes associated with tea-quality and stress response. BMC Genomics 16:298 (DOI: 10.1186/s12864-015-1494-4)

Qiu-yang Yao, En-hua Xia, Fei-hu Liu, Gao L. Z.* 2015. Genome-wide identification and comparative analysis of expression profiling reveal a rapid expansion and functional divergence of duplicated genes of WRKY gene family in cabbage, Brassica oleracea var. capitata. Gene 557(1):35-42.

Qun-jie Zhang, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, En-hua Xia, Chao Shi, Yun-long Liu, Yun Zhang, Yuan Liu, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Li-ping Zhang, Hui Huang, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Qiu-yang Yao, Fan-chun Zeng, Li-li Yang, Ju Gao, Da-yun Tao, Yue-ju Wang, Jeffery L. Benntzen, Gao L. Z.*. 2014. Rapid diversification of five Oryza AA genomes associated with rice adaptation. Proc Natl Acad Sci USA 111 (46) E4954-E4962 (doi/10.1073/pnas.1418307111)

En-Hua Xia, Jian-Jun Jiang, Li-Ping Zhang, Hui Huang, Hai-Bin Zhang, Gao L. Z.* 2014. Transcriptome analysis of the oil-rich tea plant, Camellia oleifera, reveals candidate genes related to lipid metabolism. PLoS ONE 9(8): e104150. doi:10.1371/journal.pone.0104150

Ju Gao, Shuo Wang, Gao L. Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of Phyllostachys sulphurea (Poaceae: Bambusoideae). Mitochondrial DNA (doi: 10.3109/19401736.2014.926516)

Ju Gao, Kui Li, Gao L. Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of Bambusa multiplex (Poaceae: Bambusoideae). Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.926515)

Hui Huang, Chao Shi, Yuan Liu, Shu-yan Mao, Gao L. Z.*. 2014. Thirteen Camellia chloroplast genome sequences determined by high-throughput sequencing: genome structure and phylogenetic relationships. BMC Evolutionary Biology 14:151 doi:10.1186/1471-2148-14-151

Qun-jie Zhang, Gao L.Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of desert poplar (Populus euphratica). Mitochondrial DNA (DOI: 10.3109/19401736.2014.913159)

Fan-chun Zeng, Cheng-wen Gao, Gao L.Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of American bird pepper (Capsicum annuum var. glabriusculum). Mitochondrial DNA (DOI: 10.3109/19401736.2014.913160)

Xiao-di Hu, En-hua Xia, Gao L. Z.* 2014. The complete mitochondrial genome of eastern lowland gorilla, Gorilla beringei graueri,and comparative mitochondrial genomics of the Gorilla species. Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.953103)

Xiao-di Hu, Kui Li, Gao L. Z.* 2014. The complete mitochondrial genome of celebes wild boar, Sus celebensis (Cetartiodactyla: Suina: Suidae) and comparative mitochondrial genomics of the Sus species. Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.953099)

Xiao-di Hu, Gao L. Z.* 2014. The complete mitochondrial genome of domestic sheep, Ovis aries. Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.953076)

Cheng-wen Gao, Shuo Wang, Gao L. Z.*. 2013. Complete mitochondrial genome of the black flying fox, Pteropus alecto (Chiroptera: Megachiroptera: Pteropodidae). Mitochondrial DNA (doi: 10.3109/19401736.2013.869691)

Jian-Jun Jiang, En-Hua Xia, Cheng-Wen Gao, Gao L. Z.*. 2013. The complete mitochondrial genome of the western painted turtle, Chrysemys picta bellii (Chrysemys, Emydidae). Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2013.873900)

Xin-chun Mo, Ju Gao, Gao L. Z.*. 2013. Characterization of microsatellite markers and their application to genetic diversity analysis of Brachypodium sylvaticum var. breviglume from Yunnan, China. American Journal of Plant Sciences 4 (7):1427-1434.

Shuo Wang, Chao Shi, Gao L. Z.* 2013. Plastid genome sequence of a wild woody oil species, Prinsepia utilis, provides insights into evolutionary and mutational patterns of Rosaceae chloroplast genomes. PLoS ONE 8(9):e73946. doi: 10.1371/journal.pone.0073946.

Yan Tong, Chun-Yan Wu, Gao L. Z.* 2013. Characterization of chloroplast microsatellite loci from whole chloroplast genome of Camellia taliensis and their utilization for evaluating genetic diversity of C. reticulata (Theaceae). Biochemical Systematics and Ecology 50: 207–211

Jing Wu, Xiu-ying Kong, Chao Shi, Cui-yun jin, Gao L. Z.*, Ji-zeng Jia*. 2013. Dynamic evolution of Rht1 homologous regions in grass genomes. PLoS ONE 8(9):e75544. doi:10.1371/journal.pone.0075544

Hui Huang, Yan Tong, Qun-jie Zhang, Gao L.Z.*. 2013. Genome size variation among and within Camellia species by using flow cytometric analysis and high-throughout genome sequencing. PLoS ONE 8(5): e64981. doi:10.1371/journal.pone.0064981

Chao Shi, Yuan Liu, Hui Huang, En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Gao L.Z.*. 2013. Contradiction between plastid gene transcription and function due to complex posttranscriptional splicing: an exemplary study of ycf15 function and evolution in angiosperms. PLoS ONE 8(3): e59620. doi:10.1371/journal.pone.0059620

Zhu T, Xu PZ, Liu JP, Peng S, Mo XC, Gao L. Z.*. 2013. Phylogenetic relationships and genome divergence among AA- genome species of the genus Oryza as revealed by 53 nuclear genes and 16 intergenic regions. Molecular Phylogenetics and Evolution 70: 348–361

Wen-kai Jiang, Yun-long Liu, En-hua Xia, Gao L. Z.*. 2013. Prevalent role of gene features in determining evolutionary fates of WGD duplicated genes in flowering plants. Plant Physiology 161: 1844–1861

Shi C, Hu N, Huang H, Gao J, Zhao Y-J, Gao L. Z.*. 2012. An improved chloroplast DNA extraction procedure for whole plastid genome sequencing. PLoS ONE 7(2):e31468.doi:10.1371/journal.pone.0031468

Gao L. Z. *, Li D., Wu X., Chen W., Huang Z., Wei X.M. 2012. In Situ conservation of wild rice populations: a targeted study of common wild rice Oryza rufipogon from China. American Journal of Plant Sciences 3(7): 854-868

Liu Y., Yang S.X., Ji P. Z., Gao L. Z.* 2012. Phylogeography of Camellia taliensis (Theaceae) inferred from chloroplast and nuclear DNA: insights into evolutionary history and conservation. BMC Evolutionary Biology 12:92 doi:10.1186/1471-2148-12-92

Zhang Y, Jiang W-k, Gao L. Z.*. 2011. Evolution of microRNA genes in Oryza sativa and Arabidopsis thaliana: an update of the inverted duplication model. PLoS ONE 6(12):e28073.doi:10.1371/journal.pone.0028073

Ji, P. Z., Li, H., Gao, L. Z., Zhang, J., Cheng, Z. Q., Huang, X. Q. 2011. ISSR diversity and genetic differentiation of ancient tea (Camellia sinensis var. assamica) plantations from China: implications for precious tea germplasm conservation. Pakistan Journal of Botany 43(1): 281-291

Ya-yu Fan,Gao L. Z.*. 2011. A preliminary study on patterns of TE-gene associations in Oryza (Poaceae) and adaptive significance. Plant Diversity and Resources 33 (2): 201-208

Li Xiao-xiang, Liu Yong, Duan Yong-hong, Wang Shu-hong, Zhan Qing-cai, Sun Gui-hua, Gao L. Z. 2010. Estimation of mating system in natural Oryza rufipogon populations by SSR markers. Chinese Journal of Rice Science 24(6): 601-607

Yang Liu, Shi-xiong Yang, Gao L. Z.*. 2010. Comparative study on the chloroplast RPL32-TRNL nucleotide variation within and genetic differentiation among ancient tea plantations of Camellia sinensis var. assamica and C. taliensis (Theaceae) from Yunnan, China. Plant Diversity and Resources 32(5): 427-434

Gao L. Z.*, Hideki Innan. 2008. Non-independent domestication of the two rice subspecies, Oryza sativa subsp. indica and subsp. japonica, demonstrated by multilocus microsatellites. Genetics 179(2):965-976

Gao L. Z.*, Hongyan Xu. 2008. Patterns of mutation rate variation at microsatellites: evolutionary insights from comparisons of Asian cultivated rice (Oryza sativa L.) and related species. BMC Evolutionary Biology 8:11doi: 10.1186/1471-2148-8-11

Yin-He Zhao, Guo-Ying Wang, Jin-Peng Zhang, Jun-Bo Yang, Sheng Peng, Lian-Ming Gao, Jin-Yong Hu, De-Zhu Li, Gao L. Z. 2006. Expressed Sequence Tags (ESTs) and phylogenetic analysis of floral genes from a paleoherb species, Asarum caudigerum. Annals of Botany 98(1):157-163

Gao L. Z.*, Zhang C. H., Jia J. Z., Dong Y. S. 2006. Genetic diversity within Oryza rufipogon germplasms preserved in Chinese field genebanks of wild rice as revealed by microsatellite analysis. Biodiversity and Conservation 15: 4059-4077

Gao L. Z.*, Zhang C. H., Chang L. P., Jia J. Z., Qiu Z. En., Dong Y. S. 2005. Microsatellite diversity of Oryza sativa with emphasis on indica-japonica divergence. Genetical Research 85: 1-14

Gao L. Z.*, Zhang C. H. 2005. Comparisons of microsatellite variability and population genetic structure of two endangered wild rice species, Oryza rufipogon and O. officinalis, and their conservation implications. Biodiversity and Conservation 14: 1663-1679

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y. 2005. Pattern of allozyme variation at two stages of the life-cycle in common wild rice Oryza rufipogon Griff. and its conservation significance. Biodiversity and Conservation 14:2821–2834

Gao L. Z.* 2005. Microsatellite diversity and population genetic structure of an endangered wild rice, Oryza officinalis (Poaceae) from China. Molecular Ecology 14: 4287-4297

Gao L. Z.*, Zhang C. H., Jia J. Z , Dong Y. S. 2005. Cross-species transferability of rice microsatellites in its wild relatives and the potential for conservation genetic studies. Genetic Resources and Crop Evolution 52: 931-940

Gao L. Z.* 2004. Population structure and conservation genetics of wild rice Oryza rufipogon (Poaceae): a region-wide perspective from microsatellite variation. Molecular Ecology 13(5):1009-1024

Gao L. Z.*, McCarthy E. M., Gankgo E., McDonald J. F. 2004. Evolutionary history of Oryza sativa LTR retrotransposons: a preliminary survey of the rice genome sequences. BMC Genomics 5: 1-1

Gao L. Z., Hideki Innan. 2004. Very low gene duplication rate in the yeast genome. Science 306: 1367-1370

Gao L. Z., Zhang J. Z. 2003. Why human disease-associated mutations are identical in orthologous sites of healthy mouse? Trends in Genetics 19(12):678-681

McCarthy E. M., Liu J. D., Gao L. Z., McDonald J. F. 2002. Long terminal repeat retrotransposons of Oryza sativa. Genome Biology 3(10): research0053.1-0053.11

Gao L. Z.*, Schaal B. A., Zhang C. H., Jia J. Z., Dong Y. S. 2002. Assessment of population genetic structure of common wild rice Oryza rufipogon Griff. detected by microsatellite DNA and allozyme loci. Theoretical and Applied Genetics 106: 173-180

Gao L. Z.* 2002. The conservation of rice biodiversity in China: significance, genetic erosion, ethnobotany and prospect. Genetic Resources and Crop Evolution 50: 17-32

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y. 2001. Intra-population genetic structure and gene flow of typical population of common wild rice Oryza rufipogon Griff. Journal of Plant Research 114:107-113

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y. 2001. High levels of genetic differentiation of Oryza officinalis Wall. et Watt. from China. Journal of Heredity 92(6): 511-516

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y. 2001. Low levels of allozyme diversity and conservation genetics of common wild rice Oryza rufipogon Griff. from Yunnan, China. Euphytica 124: 273-281

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y., Chen W., Jiang W. Z. , Wang X. K. 2000. Genetic erosion in northern marginal population of common wild rice Oryza rufipogon Griff. and its conservation, revealed by allozyme analysis. Hereditas 133(1): 47-53

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y. 2000. Allozymic diversity and genetic structure of common wild rice Oryza rufipogon Griff., China. Theoretical and Applied Genetics 101 (3): 494-502

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y. 2000. Low levels of genetic diversity within population and high differentiation among populations of a wild rice, Oryza granulata Nees et. Arn. ex. Watt. from China. International Journal of Plant Sciences 161(4): 691-697

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y., Zhang J. W., Luo Q. Y., Tao G. D., Xu Z. F. 1999. Studies on population genetic structure of Oryza granulata Nees et. Arn. ex. Watt. from Yunnan and its in situ conservation significance, Science in China (Volume C) :297-302

Ge S., Oliveira G. C., Schaal B. A., Gao L. Z., Hong D. Y. 1999. RAPD variation within and between natural populations of the wild rice Oryza rufipogon Griff. from China and Brazil. Heredity 82: 638-644

Gao L. Z.*, Ge S., Hong D. Y., Zhang J. W., Luo Q. Y., Tao G. D., Xu Z. F. 1999. Studies on population genetic structure of Oryza granulata Nees et. Arn. ex. Watt. from Yunnan and its in situ conservation significance, Science in China (Volume C) 42(1): 102-108

奖励/荣誉

1997年和1999年两次获得瑞典国际科学基金会 (IFS) 荣誉研究基金。该基金会仅资助发展中国家三十岁以下年轻优秀的科学家。

1999年获得联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所(Biodiversity International)(原名为IPGRI)授予的Vavilov-Frankel Fellow。该奖项从全世界约1000余名申请人中,每年仅授予两名年轻优秀的科学家。

2008年入选中国科学院 “”并获得“引进国外杰出人才”的择优支持。

2008年入选云南省首届引进高端科技人才并获得云南省高层次科技人才培引工程专项人才基金的支持。

2009年入选人力资源社会保障部、科技部、教育部、财政部、国家发改委、国家自然科学基金委、中国科协等七部委联合设立的“新世纪百千万人才工程”国家级人选。

2011年入选云南省委首批“百名海外高层次人才引进计划”。

2011年入选云南省委联系专家。

2011年获得何梁何利科学技术青年创新奖。

2012年享受国务院政府特殊津贴。

2013年入选科技部推进计划中青年科技创新领军人才

2014年领衔入选“热带作物种质资源与基因组学”云南省创新团队。

2015年批准建立云南省委基层专家工作站。

2016年入选第三批中共中央组织部“万人计划”(“特支计划”)科技创新领军人才。