| 姓 名：高立志 | |||
| 技术职称：教授 | |||
| 学位学历：博士研究生 | |||
| 导师类别：博士生导师、硕士生导师 | |||
| 联系电话：13987105654 | |||
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邮 箱：Lgaogenomics@163.com； L.Rice.Gao@gmail.com |
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高立志 博士 教授、博士生导师
华南农业大学基因组学与生物信息学创新研究中心主任。
研究领域：
本团队长期致力于有重要科学意义和重大产业价值的代表性热带、亚热带植物（包括稻属、山茶属、人参属和橡胶树属等）开展进化基因组学、生态基因组学和保护基因组学研究。主要包括如下四个方向：1）物种形成基因组学；2）适应性进化的基因组学基础；3）趋同与趋异进化式样与机制；4）全球气候环境变化下重要濒危植物的保护基因组学与植物种质基因组学。我们还致力于研发生态基因组学与保护基因组学大数据算法流程，搭建有重要国际影响的重要热带、亚热带植物和大型高等真菌的多组学数据库。
教育经历：
1987.09-1991.07 在云南大学生物系植物学专业，获理学学士学位
1991.08-1994.07 在云南大学生物系植物学专业学习，获理学硕士学位
1994.08-1997.07 在中国科学院植物研究所学习，获理学博士学位
工作经历：
2016.11-至今 华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心主任。
2018.03-至今 湖南农业大学“神农学者”特聘教授。
2015.05-2020.05 华中农业大学园艺学院，特聘教授。
2015.06-2020.08 中国科学院特聘研究员，中国科学院大学教授；中国科学院昆明植物研究所 “一三五”植物种质资源与基因组学研究群组群长。
2014.01-2019.01 云南省热带作物科学研究所橡胶工程中心首席研究员，热带作物种质资源与基因组学重点实验室主任。
2012.01-2016.12 昆明理工大学生命科学与技术学院、信息与自动化学院特聘教授。
2011.07-09 美国佐治亚大学遗传学系 Visiting Faculty，合作教授为Jeffrey Lynn Bennetzen 院士。
2006.06-2014.12 中国科学院昆明植物研究所研究员，国家大科学装置中国西南野生生物种质资源库副主任，植物种质资源与基因组学研究中心主任。
2006.05-2007.05 在美国德克萨斯大学奥斯丁分校分子细胞与发育生物学系任Research Assistant Professor。
2005.01-2006.04 在美国休斯顿大学生物与生物化学系任Research Assistant Professor
2003.07-2004.12 在美国德克萨斯大学休斯顿分校的人类遗传学中心任Research Fellow, 合作导师为Hideki Innan教授。
2002.07-2003.06 在美国密西根大学(Ann Arbor) 生态与进化生物学系任Research Fellow, 合作导师为张建之教授。
2000.11-2002.06 在美国佐治亚大学遗传学系Susan Wessler 院士和John F. McDonald教授指导下作博士后研究。
1999.11-2000.11 被遴选为联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所的Vavilov-Frankel Fellow，赴美国华盛顿大学(圣路易斯)生物学系在 Barbara A. Schaal 院士指导下作博士后研究。
1999.10-2000.11 任中国农业科学院作物品种资源研究所稻种资源研究室副研究员。
1998.08-1998.09 在国际水稻研究所（IRRI）作访问科学家。
1997.08-1999.09 在中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点实验室董玉琛院士指导下作博士后研究。
奖励荣誉：
1997年和1999年两次获得瑞典国际科学基金会 (IFS) 荣誉研究基金。该基金会仅资助全球发展中国家三十岁以下年轻优秀的科学家
1999年获得联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所(Biodiversity International)（原名为IPGRI）授予的Vavilov-Frankel Fellow。该奖项从全世界约1000余名申请人中，每年仅授予两名年轻优秀的科学家
2008年入选中国科学院 ***并获得“***”的择优支持
2008年入选云南省首届引进高端科技人才并获得云南省***科技人才培引工程专项人才基金的支持
2009年入选人力资源社会保障部、科技部、教育部、财政部、国家发改委、国家自然科学基金委、中国科协等七部委联合设立的“新世纪***万人才工程”国家级人选
2011年入选云南省委首批“百名海外******计划”
2011年入选云南省委联系专家
2011年获得何梁何利科学技术青年创新奖
2012年享受国务院***
2013年入选科技部推进计划中青年科技创新领军人才
2014年领衔入选“热带作物种质资源与基因组学”云南省创新团队
2015年批准依托云南文山苗乡三七实业有限公司建立云南省委基层专家工作站
2016年入选第三批中共中央组织部***（“特支计划”）科技创新领军人才
2016年入选“科学中国人”年度人物
2017年入选国际茶叶组织“世界茶人奖”
2017年入选“云岭英才计划”的“云岭***人才”
学术服务：
担任BMC Evolutionary Biology（2010－2020）、BMC Evolution and Ecology（2020－）、Tropical Plant Biology（2020－）和Forestry Research（2020－）的Associate Editor；任American Journal of Plant Sciences（2010－），Frontiers in Plant Science, Genetics and Genomics Section（2010－）、International Journal of Genomics and Proteomics（2010－）、Horticultural Research（2019－）《中国科学数据》（2012－）和Horticulturae（2021－）等刊物的编委；任中国生物工程学会理事（2020-今）、中国生物工程学会生物资源专业委员会副主任委员（2017.9-今）、云南省植物学会理事（2012-2020）、云南省遗传学会理事（2012-2020）、科技部 973 项目、国家科技奖、国家外专局、国家自然科学基金委和其它国家（瑞典、法国等）基金委、教育部等评审专家；作为咨询专家参与国家环保部、质检总局和林业局等部委的项目规划；任中科院、云南省科技厅等评审与咨询专家；中国科学院战略研究系列报告《创新2050：科学技术与中国的未来》专家组成员，完成了“2050 生物质资源科技领域发展路线图战略研究报告”中的“生物质能源植物基因资源与基因组学”的编研;常年为国际学术杂志审阅稿件。
论文著作：
1. Wei Li, Cong Shi, Kui Li, Qunjie Zhang, Yan Tong, Yun Zhang, Jun Wang, Lynn Clark, Li-zhi Gao*. 2020. Draft genome of the herbaceous bamboo Raddia distichophylla.G3: Genes|Genomes|Genetics (accepted)
2. Nan, H., Lin, YL., Liu, J., Huang H., Li-zhi Gao*. 2020. Genome-wide analysis of the WRKY transcription factor gene family and their response to salt stress in rubber tree. Tropical Plant Biol.https://doi.org/10.1007/s12042-020-09268-x
3. Zhang D, Li W, Chen ZJ, Wei FG, Liu YL, Li-zhi Gao*. 2020. SMRT- and Illumina-based RNA-seq analyses unveil the ginsinoside biosynthesis and transcriptomic complexity in Panax notoginseng.Sci Rep. 2020 Sep 17;10(1):15310. doi: 10.1038/s41598-020-72291-1
4. Wei Li, Fen Zhang, Li-zhi Gao*. 2020. SMRT-based mitochondrial genome of the edible mushroom Morchella conica.Mitochondrial DNA Part B 5(3):3219-3220
5. Li-Ying Feng, Jin Liu, Cheng-Wen Gao, Hai-Bo Wu, Guo-Hua Li and Li-Zhi Gao. Higher genomic variation in wild than cultivated rubber trees, Hevea brasiliensis, revealed by comparative analyses of chloroplast genomes. Front. Ecol. Evol.| https://doi.org/10.3389/fevo.2020.00237
6. Wei Li, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, Yan Tong, Kui Li, Cong Shi, Yun Zhang, Yun-long Liu, Jian-jun Jiang, Yuan Liu, En-hua Xia, Hui Huang, Li-ping Zhang, Dan Zhang, Chao Shi, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Li-li Yang, Li-zhi Gao*.2020. Draft genomes of two outcrossing wild rice, Oryza rufipogon and O. longistaminata, reveal genomic features associated with mating-system evolution. Plant Direct.DOI: 10.1002/pld3.232
7. Cong Shi, Wei Li, Qun-Jie Zhang, Yun Zhang, Yan Tong, Kui Li, Yun-Long Liu, Li-zhi Gao*. 2020. The draft genome sequence of an upland wild rice species, Oryza granulata. Scientific Data, 7:131
8. Yan Tong, Li-zhi Gao*. 2020. Development and characterization of EST-SSR markers for Camellia reticulata: Camellia reticulata microsatellitesApplications in Plant Sciences 8(4): e11348
9. Wei Li, Kui Li, Ying Huang, Cong Shi, Wu-Shu Hu, Yun Zhang, Qun-Jie Zhang, En-Hua Xia, Ge-Ran Hutang, Xun-Ge Zhu, Yun-Long Liu, Yuan Liu, Yan Tong, Ting Zhu, Hui Huang, Dan Zhang, Yuan Zhao, Wen-Kai Jiang, Jie Yuan, Yong-Chao Niu, Cheng-Wen Gao, Li-zhi Gao*. 2020. SMRT sequencing of the Oryza rufipogon genome reveals the genomic basis of rice adaptation. Communications Biology, 3:167
10. Qun-Jie Zhang, Wei Li, Kui Li, Hong Nan, Cong Shi, Yun Zhang, Zhang-Yan Dai, Yang-Lei Lin, Xiao-Lan Yang, Yan Tong, Dan Zhang, Cui Lu, Li-Ying Feng, ChenFeng Wang, Xiao-Xin Liu, Jian-An Huang, Wen-Kai Jiang, Xing-Hua Wang, XingCai Zhang, Evan E. Eichler, Zhong-Hua Liu, Li-zhi Gao*. 2020. The Chromosome-Level Reference Genome of Tea Tree Unveils Recent Bursts of Non-autonomous LTR Retrotransposons to Drive Genome Size Evolution. Molecular Plant. DOI: 10.1016/j.molp.2020.04.009（首次发表的达到染色体水平的小叶茶茶树基因组，发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
11. Hong Nan, Wei L, Yang-lei Lin, Li-zhi Gao*. 2020. Genome-Wide Analysis of WRKY Genes and Their Response to Salt Stress in the Wild Progenitor of Asian Cultivated Rice, Oryza rufipogon. Frontiers in Genetics, 11:359
12. Jin Liu, Cong Shi, Cheng-Cheng Shi, Wei Li, Qun-Jie Zhang, Yun Zhang, Kui Li, Hui-Fang Lu, Chao Shi, Si-Tao Zhu, Zai-Yun Xiao, Hong Nan, Yao Yue, Xun-Ge Zhu, Yu Wu, Xiao-Ning Hong, Guang-Yi Fan, Yan Tong, Dan Zhang, Chang-Li Mao, Yun-Long Liu, Shi-Jie Hao, Wei-Qing Liu, Mei-Qi Lv, Hai-Bin Zhang, Yuan Liu, Ge-Ran Hu-tang, Jin-Peng Wang, Jia-Hao Wang, Ying-Huai Sun, Shu-Bang Ni, Wen-Bin Chen, Xing-Cai Zhang, Yuan-Nian Jiao, Evan E. Eichler, Guo-Hua Li, Xin Liu, Li-Zhi Gao*. 2020. The Chromosome-Based Rubber Tree Genome Provides New Insights into Spurge Genome Evolution and Rubber Biosynthesis. Molecular Plant, 13(2): 336-350（首次发表的达到染色体水平的橡胶树基因组，发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
13. Wei Li, Kui Li, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, Yun Zhang, Cong Shi, Yun-long Liu, En-hua Xia, Jian-jun Jiang, Chao Shi, Li-ping Zhang, Hui Huang, Yan Tong, Yuan Liu, Dan Zhang, Yuan Zhao, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Li-li Yang, Guo-ying Yin, Li-zhi Gao. 2020. Improved hybrid denovo genome assembly and annotation of African wild rice, Oryza longistaminata, from Illumina and PacBio sequencing reads. ThePlant Genome, e20001
14. Fen Zhang, Wei Li, Cheng-wen Gao, Dan Zhang, Li-zhi Gao*. 2019.. Deciphering tea tree chloroplast and mitochondrial genomes of Camellia sinensis var. assamica. Scientific Data, 6:209
15. Li-Zhi Gao*, Yun-Long Liu, Dan Zhang, Wei Li, Ju Gao, Yuan Liu, Kui Li, Chao Shi, Yuan Zhao, You-Jie Zhao, Jun-Ying Jiao, Shu-Yan Mao, Cheng-Wen Gao, Evan E. Eichler. 2019. Evolution of Oryza chloroplast genomes promoted adaptation to diverse ecological habitats. Communications Biology, 3:278
16. Hong Nan, Gao L. Z. *.2019. Genome-wide analysis of WRKY genes and their response to hormone and mechanic stresses in carrot. Frontiers in Genetics 10:363. doi: 10.3389/fgene.2019.00363
17. You-jun Huang, …,Gao L. Z. , Jian-qin Huang.2019. The genomes of pecan and Chinese hickory provide insights into Carya evolution and nut nutrition.GigaScience 8(5)
18. Zhong-hua Liu, Gao L. Z., Zong-mao Chen, Xiao-xiong Zeng, Jian-an Huang, Yu-shun Gong, Qin Li, Shuo-qian Liu, Yong Lin, Shu-xian C ai, Sheng Zhang, Li-gui Xiong, Wei Li, Li Zhou, Xinru Wang, Feng-jian Luo, Qun-jie Zhang, Dan Zhang. 2019. Leading progress on genomics, health benefits and utilization of tea resources in China. Nature 556(7742). https://www.nature.com/articles/d42473-019-00032-8（与刘仲华院士和陈宗懋院士共同在Nature上组织了茶叶专刊，受到国内外的高度关注）
19. Hui Huang, Qiuyang Yao, Enhua Xia, and Gao L. Z.*. 2018. Metabolomics and transcriptomics analyses reveal nitrogen influences on the accumulation of flavonoids and amino acids in young shoots of tea plant (Camellia sinensis L.) associated with tea flavor.J. Agric. Food Chem.66, 9828−9838
20. Junki Lee, Nomar Espinosa Waminal, Hong-Il Choi, Sampath Perumal, Sang-Choon Lee, Van Binh Nguyen, Woojong Jang, Nam-Hoon Kim, Gao L. Z., and Tae-Jin Yang. 2017. Rapid amplification of four retrotransposon families promoted speciation and genome size expansion in the genus Panax. Scientific Reports 7(1). DOI: 10.1038/s41598-017-08194-5
21. Hui Huang, En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Qiu-Yang Yao, Gao L. Z.*. 2017. De novotranscriptome sequencing of Camellia sasanqua and the analysis of major candidate genes related to floral traits. Plant Physiology and Biochemistry120: 103-111
22. Xi Du, Qi Zhao, En-Hua Xia, Gao L. Z., Franck Richard, Zhu L. Yang. 2017. Mixed-reproductive strategies, competitive mating-type distribution and life cycle of fourteen black morel species. Scientific Reports 7: 1493 DOI:10.1038/s41598-017-01682-8
23. Jia-huan Xu, Hai-bo Wu, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome sequence of the threatened trident maple Acer buergerianum (Aceraceae). Mitochondrial DNA Part B 2:1, 273-274, DOI: 10.1080/23802359.2017.1325345
24. Qun-Jie Zhang，Gao L. Z.*. 2017. Rapid and recent evolution of LTR retrotransposons drives rice genome evolution during the speciation of AA- genome Oryza species.G3-Genes Genomes Geneticshttps://doi.org/10.1534/g3.116.037572（作为一个新的“研究亮点”，Genetics杂志对该工作进行了点评）
25. Wei Li, Yuan Liu, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome of the endangered wild Musa itinerans (Zingiberales: Musaceae). Conservation Genetics ResourcesDOI: 10.1007/s12686-017-0737-x
26. Ge-Ran Hutang, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome sequence of Leersia perrieri of the rice tribe Oryzeae (Poaceae). Conservation Genetics Resources DOI: 10.1007/s12686-017-0729-x
27. En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Jun Sheng, Kui Li, Qun-Jie Zhang, Changhoon Kim, Yun Zhang, Yuan Liu, Ting Zhu, Wei Li, Hui Huang, Yan Tong, Hong Nan, Cong Shi, Chao Shi, Jian-Jun Jiang, Shu-Yan Mao, Jun-Ying Jiao, Dan Zhang, Yuan Zhao, You-Jie Zhao, Li-Ping Zhang, Ben-Ying Liu, Yue Yu, Sheng-Fu Shao, De-Jiang Ni, Evan E. Eichler, Gao L. Z.*. 2017.The tea tree genome provides insights into tea flavor and independent evolution of caffeine biosynthesis. Molecular Plant (http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.04.002)（作为国际上首次破译的茶树基因组，发表后被CCTV（新闻联播）、CNN、BBC、华盛顿邮报等几乎所有国内外重要的新闻媒体报刊的采访、报道或转载；该论文被中国科学技术协会遴选为“优秀期刊论文”；是ESI高被引论文）
28. En-Hua Xia, Da-Rong Yang, Jian-Jun Jiang, Qun-Jie Zhang, Yuan Liu, Yun-Long Liu, Yun Zhang, Hai-Bin Zhang, Cong Shi, Yan Tong, Changhoon Kim, Hua Chen, Yan-Qiong Peng, Yue Yu, Wei Zhang, Evan E. Eichler, Gao L. Z.*. 2017.The caterpillar fungus, Ophiocordyceps sinensis, genome provides insights into highland adaptation of fungal pathogenicity. Scientific Reports 7(1): 1806. doi: 10.1038/s41598-017-01869-z.
29. Dan Zhang, Wei Li, En-hua Xia, Qun-jie Zhang, Yuan Liu, Yun Zhang, Yan Tong, Yuan Zhao, Yong-chao Niu, Jia-huan Xu, Gao L. Z.*. 2017. The medicinal herb Panax notoginseng genome provides insights into ginsenoside biosynthesis and genome evolution. Molecular Plant 10: 903–907（首次发表的人参属三七基因组，发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
30. Fan-chun Zeng, You-Jie Zhao, Que-jie Zhang,Gao L. Z.*. 2017. LTRtype, an efficient tool to predict structurally complex LTR retrotransposon elements and nested insertions. Frontiers in Plant Science 8:402. doi: 10.3389/fpls.2017.00402
31. T Mornkham, PP Wangsomnuk, XC Mo, FO Francisco, Gao L. Z., H Kurzweil. 2016. Development and characterization of novel EST-SSR markers and their application for genetic diversity analysis of Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus L.). Genetics and Molecular Research: GMR doi: 10.4238/gmr15048857
32. Huang J, Zhang C, Zhao X, Fei Z, Wan K, Zhang Xiaoming Pang, Yin X, Bai Y, Sun X, Gao L. Z., Li R, Zhang J, Li X. 2016. The jujube genome provides insights into genome evolution and the domestication of sweetness/acidity taste in fruit trees. PLoS Genetics 12(12): e1006433. doi:10.1371/journal.pgen.1006433
33. Qing-Xia Ding, Jia Liu , Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome of eggplant (Solanum melongena L.). Mitochondrial DNA Part B 1:1, 843-844, DOI:10.1080/23802359.2016.1186510
34. Cheng-wen Gao, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of semi-wild soybean, Glycine gracilis (Fabales: Fabaceae). Conservation Genetics Resources (DOI: 10.1007/s12686-016-0683-z)
35. Cheng-wen Gao, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of wild soybean, Glycine soja (Fabales: Fabaceae). Conservation Genetics Resources (DOI 10.1007/s12686-016-0659-z)
36. Dan Zhang, Yuan Liu, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of Phyllostachys heterocycla, a fast-growing non-timber bamboo (Poaceae: Bambusoideae). Conservation Genetics Resources (DOI: 10.1007/s12686-016-0654-4)
37. Shuo Wang, Gao L. Z.*. 2016. Complete chloroplast genome sequence and annotation of the tropical japonica group of Asian cultivated rice (Oryza sativa L.). Genome Announcement18;4(1). pii: e01703-15. doi: 10.1128/genomeA.01703-15
38. Gao L. Z.*, Dan Zhang, Kui Li, Ju Gao. 2016. The complete plastid genome sequence of the wild-rice Zizania latifolia and comparative chloroplast genomics of the tribe Oryzeae. Frontiers in Ecology and Evolution4:88.doi: 10.3389/fevo.2016.00088
39. Chao Shi, Shuo Wang, En-Hua Xia, Jian-Jun Jiang, Fan-Chun Zeng, Qiu-Yang Yao, and Gao L. Z.*. 2016. Full transcription of the photosynthetic eukaryote chloroplast genome. Scientific Reports 6 doi:10.1038/srep30135（2016-08-05的【CCTV13】（朝闻天下）以“中科院发现叶绿体基因全转录新机制”为题对该研究成果做了采访报道；发表后被国内外其它重要媒体报道）
40. Gao L. Z.*, Cheng-wen Gao. 2016. Lowered diversity and increased inbreeding depression within peripheralpopulations of an endangered wild rice Oryza rufipogon. PLoS ONE11(3): e0150468. doi: 10.1371/journal.pone.0150468
41. Qiu-Yang Yao, Hui Huang, Yan Tong, Gao L. Z.*. 2016. Transcriptome sequencing reveals gene expression profiles of flavonoid and fatty acid biosynthesis pathways and the development of EST-SSR markers in Camellia reticulata (Theaceae). Frontiers in Plant Science doi: 10.3389/fpls.2016.00163
42. En-Hua Xia*, Qiu-Yang Yao*, Hai-Bin Zhang, Jian-Jun Jiang, Li-Ping Zhang, Gao L. Z.*. 2016.CandiSSR: an efficient pipeline used for identifying candidate polymorphic SSRs based on multiple assembled sequences. Frontiers in Plant Science 6:1171. doi: 10.3389/fpls.2015.01171
43. Wang S, Shi C, Zhang YJ, Hu GX, Gao L. Z.*. 2016. Trading away ancient amber's secrets. Science 351(6276):926. doi: 10.1126/science.351.6276.926-a. （发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
承担科研项目情况：
1. 瑞典国际科学基金会（C/2738-1,2）：中国野生稻的收集、调查和遗传多样性与保护生物学研究（1997.8-2002.12），2.4万美元，已顺利结题。
2. 联合国粮农组织国际植物遗传资源研究所（IPGRI）：利用SSR评价中国普通野生稻的群体遗传结构及其原生境保护的研究（1999.5-2002.5），1.5万美元，已顺利结题。
3. 国家自然科学基金(30025005)：颗粒野生稻的群体遗传结构和濒危机制的研究（1998.1-2001.12），12.5万，已顺利结题。
4. 中国博士后管理委员会项目：亚洲栽培稻及其野生近缘植物基于遗传图谱的遗传多样性研究（1997.8-1999.9），4万，已顺利结题。
5. 中国科学院“九五”重大项目(KZ951-B1-102)：中国药用野生稻的遗传多样性和保护生物学研究（“中国重要珍稀濒危植物的保护生物学研究”子专题，1998.6-2002.12），4万，项目主持人为洪德元院士和葛颂研究员，本人为子课题主持人, 已顺利结题。
6. 中国科学院知识创新工程方向性重点项目(KSCX2-YW-N-029)：重要野生禾本科植物的比较基因组学和重要功能基因的研究(2007.1-2009.12)，130万，已顺利结题。
7. 国家科技部“973 ”项目(2007CB815701)：重要栽培植物的人工选择与基因组进化（2007.1-2012.12），60万，子专题负责人，已顺利结题。
8. 中国科学院昆明植物研究所 *** ***启动项目（51O602511121）：栽培稻及野生近缘植物的进化与比较功能基因组学研究（2007.1-2010.12），73万，已顺利结题。
9. 中国科学院昆明植物研究所创新三期领域前沿重点项目（672705232515）：云南大叶茶的种质资源与基因组学的初步研究（2008.1-2012.12），80万，已顺利结题.
10. 云南省自然科学基金重点项目（2008CC016）：云南大叶茶的起源及其重要品质相关基因的比较功能基因组学研究（2009.1-2011.12），45 万，已顺利结题.
11. 中国科学院***择优支持项目：云南大叶茶、云南山茶花和油茶的比较功能基因组学与种质资源的初步研究（2009.1-2011.12），200万，已顺利结题。云南省高端科技***项目（20080A009）：云南大叶茶重要品质相关基因的比较功能基因组学研究（2009.1-2011.12），300万，已顺利结题。国家自然科学基金NSFC-云南联合基金项目（U0936603）：油茶、云南大叶茶和云南山茶种质资源的保护和比较功能基因组学研究”（2010.1-2013.12）,185万，已顺利结题。
14. 云南省自然科学基金重点项目：云南普通野生稻种质资源和基因组学的初步研究（2011.1-2013.12），40万，已顺利结题。
15. 云南省农业创新行动计划：云南大叶茶种质资源保护和基因组学研究（2011.1-2015.12），180万，已顺利结题。
16. 云南省农业创新行动计划：橡胶树种质资源保护和基因组学研究（2014.1-2016.12），500万，已顺利结题。
17. 国家自然科学基金NSFC-云南省联合基金项目（U1902205）：基于代谢组学与全基因组关联分析解析云南三七重要农艺性状与代谢化合物及其优异种质资源的发掘利用，2020/01/01-2023/12/31，228万，执行中。
